El Programa, adscrit orgànicament a la Secretaria de Salut Pública i sota la direcció d'actuacions de les sub-direccions regionals en què aquesta s'estructura territorialment, té per objecte el control de la infecció i la supervisió de mesures preventives davant de la COVID-19 tant als centres residencials com als centres de treball de les empreses agroalimentàries, i ha de permetre entomar els brots i una nova onada de la malaltia de manera ràpida i eficaç i garantir, d'aquesta manera, la minimització de la transmissió del virus SARS-CoV-2 dins d'aquests centres, i, així mateix, donar suport administratiu en el territori als diferents serveis de Vigilància Epidemiològica i Resposta a Emergències de Salut Pública en relació amb l'estudi epidemiològic dels casos i contactes amb COVID-19 i el seu seguiment en aquesta nova situació.
Per a l'execució d'aquest Programa, adscrit a la Secretaria de Salut Pública, s'han d'incorporar 95 efectius.